Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS58

Clec4b1, Antigen presenting cell lectin-like receptor A2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4b1Q7TS58 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clec4b1Q7TS58 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clec4b1Q7TS58 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Clec4b1Q7TS58 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Clec4b1Q7TS58 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Clec4b1Q7TS58 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Clec4b1Q7TS58 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Clec4b1Q7TS58 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Clec4b1Q7TS58 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Clec4b1Q7TS58 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Clec4b1Q7TS58 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Clec4b1Q7TS58 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Clec4b1Q7TS58 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Clec4b1Q7TS58 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clec4b1Q7TS58 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clec4b1Q7TS58 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clec4b1Q7TS58 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clec4b1Q7TS58 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clec4b1Q7TS58 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clec4b1Q7TS58 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Clec4b1Q7TS58 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clec4b1Q7TS58 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clec4b1Q7TS58 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clec4b1Q7TS58 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clec4b1Q7TS58 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clec4b1Q7TS58 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Clec4b1Q7TS58 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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