Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDJ1

Cachd1, VWFA and cache domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cachd1Q6PDJ1 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cachd1Q6PDJ1 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cachd1Q6PDJ1 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cachd1Q6PDJ1 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cachd1Q6PDJ1 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cachd1Q6PDJ1 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cachd1Q6PDJ1 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cachd1Q6PDJ1 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cachd1Q6PDJ1 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cachd1Q6PDJ1 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cachd1Q6PDJ1 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cachd1Q6PDJ1 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cachd1Q6PDJ1 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cachd1Q6PDJ1 Gm15636-201ENSMUST00000119205 668 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cachd1Q6PDJ1 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cachd1Q6PDJ1 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cachd1Q6PDJ1 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cachd1Q6PDJ1 Gm5873-201ENSMUST00000177157 1066 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cachd1Q6PDJ1 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cachd1Q6PDJ1 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cachd1Q6PDJ1 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cachd1Q6PDJ1 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cachd1Q6PDJ1 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cachd1Q6PDJ1 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cachd1Q6PDJ1 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cachd1Q6PDJ1 4933427E13Rik-201ENSMUST00000044347 381 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cachd1Q6PDJ1 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cachd1Q6PDJ1 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cachd1Q6PDJ1 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cachd1Q6PDJ1 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cachd1Q6PDJ1 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cachd1Q6PDJ1 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cachd1Q6PDJ1 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cachd1Q6PDJ1 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cachd1Q6PDJ1 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cachd1Q6PDJ1 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cachd1Q6PDJ1 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cachd1Q6PDJ1 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cachd1Q6PDJ1 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cachd1Q6PDJ1 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cachd1Q6PDJ1 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cachd1Q6PDJ1 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cachd1Q6PDJ1 Cdc42-202ENSMUST00000051477 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cachd1Q6PDJ1 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cachd1Q6PDJ1 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Cachd1Q6PDJ1 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cachd1Q6PDJ1 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cachd1Q6PDJ1 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cachd1Q6PDJ1 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cachd1Q6PDJ1 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cachd1Q6PDJ1 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cachd1Q6PDJ1 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cachd1Q6PDJ1 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cachd1Q6PDJ1 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cachd1Q6PDJ1 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cachd1Q6PDJ1 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cachd1Q6PDJ1 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cachd1Q6PDJ1 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cachd1Q6PDJ1 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cachd1Q6PDJ1 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cachd1Q6PDJ1 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cachd1Q6PDJ1 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cachd1Q6PDJ1 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cachd1Q6PDJ1 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cachd1Q6PDJ1 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cachd1Q6PDJ1 Efna1-203ENSMUST00000118860 1403 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cachd1Q6PDJ1 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cachd1Q6PDJ1 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cachd1Q6PDJ1 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cachd1Q6PDJ1 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cachd1Q6PDJ1 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cachd1Q6PDJ1 Rpl7a-ps11-201ENSMUST00000118791 801 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cachd1Q6PDJ1 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cachd1Q6PDJ1 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cachd1Q6PDJ1 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cachd1Q6PDJ1 Gemin7-205ENSMUST00000122127 652 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cachd1Q6PDJ1 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cachd1Q6PDJ1 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cachd1Q6PDJ1 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cachd1Q6PDJ1 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cachd1Q6PDJ1 Gm6859-201ENSMUST00000218614 989 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cachd1Q6PDJ1 Tnfrsf14-205ENSMUST00000219534 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cachd1Q6PDJ1 AC124356.1-201ENSMUST00000221469 698 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cachd1Q6PDJ1 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cachd1Q6PDJ1 AC153153.1-201ENSMUST00000225803 793 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cachd1Q6PDJ1 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cachd1Q6PDJ1 Gm16477-201ENSMUST00000085365 801 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cachd1Q6PDJ1 Gm17415-201ENSMUST00000096427 789 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cachd1Q6PDJ1 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cachd1Q6PDJ1 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cachd1Q6PDJ1 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cachd1Q6PDJ1 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cachd1Q6PDJ1 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cachd1Q6PDJ1 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cachd1Q6PDJ1 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cachd1Q6PDJ1 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cachd1Q6PDJ1 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cachd1Q6PDJ1 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cachd1Q6PDJ1 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cachd1Q6PDJ1 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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