Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Rnf149Q3U2C5 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf149Q3U2C5 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf149Q3U2C5 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf149Q3U2C5 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf149Q3U2C5 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf149Q3U2C5 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf149Q3U2C5 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf149Q3U2C5 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf149Q3U2C5 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf149Q3U2C5 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf149Q3U2C5 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Rnf149Q3U2C5 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf149Q3U2C5 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Rnf149Q3U2C5 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf149Q3U2C5 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Rnf149Q3U2C5 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rnf149Q3U2C5 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Rnf149Q3U2C5 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Rnf149Q3U2C5 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Rnf149Q3U2C5 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf149Q3U2C5 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Rnf149Q3U2C5 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf149Q3U2C5 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf149Q3U2C5 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf149Q3U2C5 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf149Q3U2C5 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf149Q3U2C5 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf149Q3U2C5 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf149Q3U2C5 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Rnf149Q3U2C5 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf149Q3U2C5 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf149Q3U2C5 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rnf149Q3U2C5 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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