Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 AC123619.1-203ENSMUST00000225276 2757 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Pot1b-201ENSMUST00000086876 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Sdc2-201ENSMUST00000022871 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Mef2a-204ENSMUST00000107476 4759 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Ctso-201ENSMUST00000029649 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Samsn1-201ENSMUST00000114239 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Ddx24-206ENSMUST00000221211 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Zfp512-201ENSMUST00000076264 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 M1ap-201ENSMUST00000113980 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Gm35715-201ENSMUST00000197421 2054 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Ndrg1-201ENSMUST00000005256 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Lmx1a-202ENSMUST00000111377 3200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ccbe1Q3MI99 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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