Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms