Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gjb2Q00977 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gjb2Q00977 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms