Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tfap2aP34056 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tfap2aP34056 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tfap2aP34056 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Tfap2aP34056 Gripap1-201ENSMUST00000065932 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tfap2aP34056 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tfap2aP34056 Amph-201ENSMUST00000003345 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tfap2aP34056 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tfap2aP34056 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tfap2aP34056 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tfap2aP34056 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tfap2aP34056 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tfap2aP34056 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tfap2aP34056 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Tfap2aP34056 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Wars-205ENSMUST00000161410 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Klhl22-202ENSMUST00000120488 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Stra6-201ENSMUST00000034880 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Ywhag-201ENSMUST00000055808 3520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Zc3hav1-202ENSMUST00000114898 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Eef2-201ENSMUST00000047864 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Gm21874-202ENSMUST00000190315 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Grb10-202ENSMUST00000109653 2048 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Pomgnt1-204ENSMUST00000120083 2953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Duoxa1-203ENSMUST00000110538 2467 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Tex11-202ENSMUST00000113716 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Dglucy-201ENSMUST00000069782 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Zfp512-201ENSMUST00000076264 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Tfap2aP34056 Sun1-204ENSMUST00000110882 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms