Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Sp100O35892 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sp100O35892 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Setd1b-201ENSMUST00000056053 7362 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sp100O35892 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sp100O35892 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Sp100O35892 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Sp100O35892 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sp100O35892 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms