Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Casq1O09165 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Casq1O09165 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Casq1O09165 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Casq1O09165 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Casq1O09165 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Casq1O09165 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Casq1O09165 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms