Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms