Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Tlr5Q9JLF7 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tlr5Q9JLF7 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms