Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Usp29Q9ES63 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Usp29Q9ES63 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Usp29Q9ES63 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Usp29Q9ES63 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Usp29Q9ES63 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Usp29Q9ES63 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp29Q9ES63 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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