Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
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Nhlrc3Q8CCH2 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
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Nhlrc3Q8CCH2 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Nhlrc3Q8CCH2 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
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