Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ubash3bQ8BGG7 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms