Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms