Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tnfsf15Q5UBV8 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tnfsf15Q5UBV8 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tnfsf15Q5UBV8 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tnfsf15Q5UBV8 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tnfsf15Q5UBV8 Gm37451-201ENSMUST00000194718 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tnfsf15Q5UBV8 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tnfsf15Q5UBV8 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Cr1l-204ENSMUST00000193094 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp780b-201ENSMUST00000081618 3004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem30c-203ENSMUST00000120112 3478 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Anln-201ENSMUST00000040912 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Olfr478-202ENSMUST00000210173 2477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Gm4884-201ENSMUST00000164422 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Cux1-211ENSMUST00000176745 2831 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tnfsf15Q5UBV8 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms