Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 Vmn1r75-201ENSMUST00000057229 918 ntAPPRIS P2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Vmn1r12-201ENSMUST00000073384 924 ntAPPRIS P2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Gm17791-201ENSMUST00000185660 1501 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Gm44951-201ENSMUST00000206449 2024 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Gm12790-201ENSMUST00000106916 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Lrrc51-207ENSMUST00000106967 675 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Tbata-208ENSMUST00000143207 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Gm3102-201ENSMUST00000164236 489 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Gm17064-201ENSMUST00000167690 452 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Vmn1r25-201ENSMUST00000176572 1101 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Gm8257-203ENSMUST00000179215 489 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 9330179D12Rik-202ENSMUST00000180811 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Platr5-202ENSMUST00000181016 479 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 4930548G14Rik-202ENSMUST00000190364 1185 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Gm18181-201ENSMUST00000190670 736 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Gm37020-201ENSMUST00000195303 992 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Olfr1086-202ENSMUST00000213198 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Gm36719-201ENSMUST00000219518 927 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 AC154184.2-201ENSMUST00000225335 349 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 AC117656.3-204ENSMUST00000225656 859 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Olfr970-201ENSMUST00000071132 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Olfr1301-201ENSMUST00000080094 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 1700007E05Rik-201ENSMUST00000186196 1513 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Fbxw23-202ENSMUST00000198480 1388 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fam117bQ3U3E2 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Fam117bQ3U3E2 Ralyl-203ENSMUST00000171075 1459 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Fam117bQ3U3E2 Casp1-201ENSMUST00000027015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Fam117bQ3U3E2 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam117bQ3U3E2 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam117bQ3U3E2 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam117bQ3U3E2 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam117bQ3U3E2 Gm43785-201ENSMUST00000201036 1345 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam117bQ3U3E2 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam117bQ3U3E2 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam117bQ3U3E2 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam117bQ3U3E2 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam117bQ3U3E2 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam117bQ3U3E2 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam117bQ3U3E2 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam117bQ3U3E2 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam117bQ3U3E2 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam117bQ3U3E2 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam117bQ3U3E2 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam117bQ3U3E2 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam117bQ3U3E2 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam117bQ3U3E2 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam117bQ3U3E2 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam117bQ3U3E2 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam117bQ3U3E2 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam117bQ3U3E2 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam117bQ3U3E2 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fam117bQ3U3E2 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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