Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfixP70257 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfixP70257 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfixP70257 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfixP70257 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NfixP70257 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NfixP70257 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfixP70257 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfixP70257 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfixP70257 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfixP70257 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfixP70257 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfixP70257 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfixP70257 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NfixP70257 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NfixP70257 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfixP70257 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfixP70257 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NfixP70257 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfixP70257 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfixP70257 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfixP70257 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfixP70257 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NfixP70257 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfixP70257 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfixP70257 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfixP70257 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfixP70257 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
NfixP70257 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfixP70257 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfixP70257 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfixP70257 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfixP70257 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfixP70257 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfixP70257 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
NfixP70257 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfixP70257 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfixP70257 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfixP70257 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfixP70257 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfixP70257 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfixP70257 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfixP70257 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfixP70257 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfixP70257 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfixP70257 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfixP70257 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfixP70257 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfixP70257 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfixP70257 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NfixP70257 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfixP70257 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NfixP70257 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfixP70257 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NfixP70257 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfixP70257 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
NfixP70257 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfixP70257 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfixP70257 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfixP70257 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfixP70257 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfixP70257 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfixP70257 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfixP70257 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfixP70257 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfixP70257 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfixP70257 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfixP70257 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfixP70257 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NfixP70257 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfixP70257 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfixP70257 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfixP70257 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfixP70257 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfixP70257 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfixP70257 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NfixP70257 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfixP70257 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfixP70257 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NfixP70257 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfixP70257 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfixP70257 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfixP70257 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfixP70257 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NfixP70257 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfixP70257 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfixP70257 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfixP70257 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NfixP70257 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NfixP70257 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfixP70257 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfixP70257 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfixP70257 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NfixP70257 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfixP70257 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfixP70257 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfixP70257 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfixP70257 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfixP70257 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NfixP70257 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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