Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

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Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Copz1P61924 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Copz1P61924 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Copz1P61924 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms