Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp100O35892 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp100O35892 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp100O35892 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
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Sp100O35892 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Sp100O35892 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
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Sp100O35892 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sp100O35892 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sp100O35892 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Sp100O35892 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Sp100O35892 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sp100O35892 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sp100O35892 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Sp100O35892 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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