Protein–RNA interactions for Protein: J3QMH4

Gm21866, Predicted gene, 21866, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21866J3QMH4 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21866J3QMH4 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms