Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Nccrp1G3X9C2 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Nccrp1G3X9C2 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nccrp1G3X9C2 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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