Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Olfr366-202ENSMUST00000214897 5333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Casz1-201ENSMUST00000094464 4349 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Ldlr-201ENSMUST00000034713 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Ift172-201ENSMUST00000041565 5403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Mettl14-202ENSMUST00000090371 7197 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Rp1l1-201ENSMUST00000058229 6684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm37048-201ENSMUST00000194827 5578 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Myo18a-209ENSMUST00000108376 7374 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Tiam1-201ENSMUST00000002588 7290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Olfr943-205ENSMUST00000215770 8308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Tcaf1-201ENSMUST00000045054 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Cntrl-206ENSMUST00000113037 5970 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms