Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Ssxb8B1AY40 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ssxb8B1AY40 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms