Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smad1P70340 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smad1P70340 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smad1P70340 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Smad1P70340 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smad1P70340 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smad1P70340 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smad1P70340 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms