Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CartptP56388 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CartptP56388 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CartptP56388 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CartptP56388 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CartptP56388 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CartptP56388 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CartptP56388 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
CartptP56388 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CartptP56388 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CartptP56388 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
CartptP56388 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
CartptP56388 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CartptP56388 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CartptP56388 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CartptP56388 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CartptP56388 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CartptP56388 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
CartptP56388 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
CartptP56388 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CartptP56388 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
CartptP56388 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CartptP56388 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CartptP56388 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CartptP56388 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CartptP56388 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CartptP56388 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CartptP56388 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CartptP56388 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CartptP56388 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CartptP56388 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CartptP56388 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CartptP56388 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CartptP56388 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CartptP56388 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CartptP56388 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CartptP56388 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CartptP56388 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CartptP56388 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CartptP56388 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CartptP56388 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CartptP56388 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CartptP56388 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CartptP56388 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CartptP56388 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CartptP56388 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CartptP56388 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CartptP56388 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CartptP56388 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CartptP56388 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CartptP56388 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CartptP56388 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CartptP56388 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CartptP56388 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CartptP56388 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CartptP56388 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
CartptP56388 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CartptP56388 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CartptP56388 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CartptP56388 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CartptP56388 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CartptP56388 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CartptP56388 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CartptP56388 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
CartptP56388 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CartptP56388 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CartptP56388 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CartptP56388 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
CartptP56388 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
CartptP56388 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CartptP56388 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CartptP56388 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CartptP56388 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CartptP56388 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CartptP56388 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CartptP56388 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CartptP56388 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CartptP56388 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CartptP56388 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CartptP56388 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CartptP56388 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CartptP56388 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CartptP56388 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CartptP56388 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CartptP56388 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
CartptP56388 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CartptP56388 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
CartptP56388 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CartptP56388 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CartptP56388 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CartptP56388 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CartptP56388 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CartptP56388 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CartptP56388 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CartptP56388 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CartptP56388 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CartptP56388 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CartptP56388 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
CartptP56388 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
CartptP56388 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.8 ms