Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Olfr1330-201ENSMUST00000094830 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Ccdc130-201ENSMUST00000005120 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Olfr874-201ENSMUST00000115004 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Gm13465-201ENSMUST00000129687 979 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Gm15339-201ENSMUST00000153577 506 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Csta1-202ENSMUST00000161638 422 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Gm16552-201ENSMUST00000162348 685 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Gm26379-201ENSMUST00000178125 138 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Gm37009-201ENSMUST00000193297 361 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Gm5851-201ENSMUST00000194132 1204 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Ighv5-12-4-201ENSMUST00000195381 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Gm18391-201ENSMUST00000217189 658 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Gm8615-201ENSMUST00000025307 771 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Lbx1P52955 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Fthl17b-201ENSMUST00000105006 842 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Gm15570-201ENSMUST00000122093 625 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Gm14699-201ENSMUST00000122340 228 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Gm13580-201ENSMUST00000131457 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Gm15489-201ENSMUST00000132811 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Gm36980-201ENSMUST00000195643 622 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lbx1P52955 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms