Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd28P31041 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd28P31041 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd28P31041 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd28P31041 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd28P31041 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd28P31041 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd28P31041 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd28P31041 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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