Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RxrbP28704 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RxrbP28704 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxrbP28704 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxrbP28704 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrbP28704 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrbP28704 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrbP28704 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrbP28704 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrbP28704 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrbP28704 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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