Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tgfb1P04202 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms