Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Efna3O08545 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Efna3O08545 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Efna3O08545 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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