Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Atg9a-201ENSMUST00000040689 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Ccdc138-201ENSMUST00000036576 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Oprm1-213ENSMUST00000105604 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Ctage5-201ENSMUST00000021384 1628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Hemgn-201ENSMUST00000071096 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 1700055D18Rik-202ENSMUST00000186030 3720 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Dhcr7-202ENSMUST00000124340 2556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Gm26574-201ENSMUST00000181876 2141 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Gpr68-202ENSMUST00000110065 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 4933439C10Rik-203ENSMUST00000132226 3184 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 D030055H07Rik-201ENSMUST00000143956 2712 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 AC153498.1-201ENSMUST00000219775 2722 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Qars-201ENSMUST00000006838 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Gm26614-201ENSMUST00000180386 3909 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Nudcd3-201ENSMUST00000066496 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Smad2-201ENSMUST00000025453 2410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Mmp9-201ENSMUST00000017881 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Vwce-201ENSMUST00000055115 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 4930478P22Rik-203ENSMUST00000202026 2060 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Gm45889-202ENSMUST00000211255 2358 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Npc1l1-201ENSMUST00000004505 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Adam1b-201ENSMUST00000079368 3338 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Entpd1-204ENSMUST00000134063 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Zscan21-202ENSMUST00000080732 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Sall4-203ENSMUST00000103074 3741 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Sppl2c-202ENSMUST00000107000 2225 ntAPPRIS P4 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Smim18J3QNP2 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
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