Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Srp54bE9PXC0 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Srp54bE9PXC0 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Srp54bE9PXC0 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Srp54bE9PXC0 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Srp54bE9PXC0 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Srp54bE9PXC0 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Srp54bE9PXC0 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms