Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Gm3550W4VSN7 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms