Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ush1cQ9ES64 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ush1cQ9ES64 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ush1cQ9ES64 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ush1cQ9ES64 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ush1cQ9ES64 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ush1cQ9ES64 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ush1cQ9ES64 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ush1cQ9ES64 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ush1cQ9ES64 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ush1cQ9ES64 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ush1cQ9ES64 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ush1cQ9ES64 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ush1cQ9ES64 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ush1cQ9ES64 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ush1cQ9ES64 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ush1cQ9ES64 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ush1cQ9ES64 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ush1cQ9ES64 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ush1cQ9ES64 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ush1cQ9ES64 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ush1cQ9ES64 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ush1cQ9ES64 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ush1cQ9ES64 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ush1cQ9ES64 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ush1cQ9ES64 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ush1cQ9ES64 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ush1cQ9ES64 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ush1cQ9ES64 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ush1cQ9ES64 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms