Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ccdc130Q9D516 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ccdc130Q9D516 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms