Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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Ercc8Q8CFD5 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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Ercc8Q8CFD5 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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Ercc8Q8CFD5 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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Ercc8Q8CFD5 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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Ercc8Q8CFD5 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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Ercc8Q8CFD5 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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Ercc8Q8CFD5 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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Ercc8Q8CFD5 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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Ercc8Q8CFD5 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
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Ercc8Q8CFD5 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
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Ercc8Q8CFD5 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ercc8Q8CFD5 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
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