Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD94

Lin52, Protein lin-52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin52Q8CD94 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lin52Q8CD94 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lin52Q8CD94 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lin52Q8CD94 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lin52Q8CD94 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Lin52Q8CD94 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Lin52Q8CD94 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lin52Q8CD94 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lin52Q8CD94 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lin52Q8CD94 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Lin52Q8CD94 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lin52Q8CD94 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Lin52Q8CD94 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lin52Q8CD94 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lin52Q8CD94 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Lin52Q8CD94 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Lin52Q8CD94 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Lin52Q8CD94 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Lin52Q8CD94 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Lin52Q8CD94 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Lin52Q8CD94 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Lin52Q8CD94 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Lin52Q8CD94 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Lin52Q8CD94 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Lin52Q8CD94 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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