Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Dsg1cQ7TSF0 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Dsg1cQ7TSF0 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms