Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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