Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Pax5Q02650 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms