Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sh3bp1P55194 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Tmem63a-201ENSMUST00000027800 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Bbs7-202ENSMUST00000108155 2437 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
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Sh3bp1P55194 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Sh3bp1P55194 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Apobec3-204ENSMUST00000175714 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sh3bp1P55194 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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