Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd28P31041 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd28P31041 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd28P31041 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd28P31041 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd28P31041 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd28P31041 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd28P31041 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd28P31041 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd28P31041 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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