Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcnaP17918 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcnaP17918 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PcnaP17918 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcnaP17918 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcnaP17918 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PcnaP17918 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcnaP17918 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcnaP17918 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PcnaP17918 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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