Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PtprbB2RU80 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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