Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm6880A3KG45 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms