Protein–RNA interactions for Protein: Q9D162

Ccdc167, Coiled-coil domain-containing protein 167, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc167Q9D162 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc167Q9D162 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms