Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ccdc113Q8C5T8 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Ccdc113Q8C5T8 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Ccdc113Q8C5T8 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Ccdc113Q8C5T8 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Ccdc113Q8C5T8 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Ccdc113Q8C5T8 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Ccdc113Q8C5T8 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Ccdc113Q8C5T8 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Ccdc113Q8C5T8 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccdc113Q8C5T8 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Ccdc113Q8C5T8 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
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