Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp54Q8BL06 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Gm26313-201ENSMUST00000157770 308 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Usp54Q8BL06 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Gm16209-201ENSMUST00000118457 627 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp54Q8BL06 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms