Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ckap2lQ7TS74 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ckap2lQ7TS74 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms